Анализ распределения частот гаплотипов генов LEP и ACVR2A в исследованных группах - Анализ ассоциаций tagSNPs и гаплотипов генов LEP и ACVR2A с развитием гестоза в популяциях русских и якутов
В настоящей работе был проведенанализ совместного наследования аллелей в гаплотипе в популяциях русских и якутов. В даннх популяциях было обнаружено всего 5 гаплотипов гена LEP (табл. 8), их количество было равным в обеих популяциях и 16 гаплотипов гена АСVR2A (табл. 9), наибольшее их количество наблюдалось в популяции якутов. При анализе распределения гаплотипов гена LEP между пациенками с гестозом и контрольной группой статистически значимых отличий не было выявлено ни в популяции русских, ни в популяции якутов(рис. 21). Анализ распределения гаплотипов гена АСVR2A между пациенками с гестозом и контрольной группой, также не выявил статистически значимых отличий в изученных популяциях (рис. 22).
Таблица 8 - Распределение частот гаплотипов гена ACVR2A В исследованных группах
№ |
Гаплотипы ACVR2A |
Частоты гаплотипов в исследуемых группах (%) | |||||||
Русские |
Якуты | ||||||||
Контроль |
Гестоз |
Гестоз* |
Гестоз** |
Контроль |
Гестоз |
Гестоз* |
Гестоз** | ||
1 |
AAGC |
53 |
45 |
48 |
44 |
55 |
58 |
59 |
58 |
2 |
GAAC |
9 |
9 |
10 |
9 |
32 |
29 |
28 |
30 |
3 |
GAAG |
25 |
28 |
29 |
27 |
7 |
5 |
7 |
5 |
4 |
ACGC |
13 |
15 |
11 |
18 |
4 |
7 |
4 |
4 |
5 |
AAGG |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
1 |
3 |
1 |
Примечание: Жирным шрифтом выделены мутантные аллели; * - Гестоз легкой и средней чтепени тяжести; ** - Тяжелый гестоз
Таблица 9 - Рспределение частот гаплотипов гена LEP в исследованных группах
№ |
Гаплотипы LEP |
Частоты гаплотипов в исследуемых группах (%) | |||||||
Русские |
Якуты | ||||||||
Контроль |
Гестоз |
Гестоз * |
Гестоз** |
Контроль |
Гестоз |
Гестоз * |
Гестоз** | ||
1 |
GATTA |
26 |
28 |
34 |
22 |
18 |
11 |
14 |
19 |
2 |
AGCTG |
24 |
20 |
20 |
22 |
6 |
7 |
4 |
3 |
3 |
GATCA |
11 |
10 |
13 |
8 |
36 |
42 |
42 |
28 |
4 |
GGTTG |
7 |
9 |
6 |
3 |
5 |
4 |
4 |
0 |
5 |
GGCTG |
6 |
4 |
3 |
3 |
3 |
0 |
3 |
0 |
6 |
GACCG |
5 |
5 |
4 |
5 |
3 |
2 |
2 |
0 |
7 |
GGTTA |
4 |
4 |
0 |
7 |
0 |
0 |
2 |
0 |
8 |
GATTG |
3 |
3 |
3 |
3 |
0 |
2 |
3 |
0 |
9 |
AGCTA |
2 |
0 |
7 |
9 |
0 |
0 |
0 |
0 |
10 |
GGTCG |
1 |
0 |
0 |
0 |
0 |
1 |
0 |
5 |
11 |
AGTTG |
0 |
2 |
0 |
3 |
2 |
3 |
5 |
2 |
12 |
AATCA |
0 |
0 |
0 |
0 |
7 |
3 |
2 |
5 |
13 |
GGTCA |
0 |
0 |
0 |
0 |
6 |
7 |
4 |
12 |
14 |
AATTA |
0 |
0 |
0 |
0 |
5 |
0 |
0 |
6 |
15 |
GGTTA |
0 |
0 |
0 |
0 |
2 |
3 |
0 |
5 |
16 |
GGCCG |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
7 |
Примечание: Жирным шрифтом выделены мутантные аллели; * - Гестоз легкой и средней чтепени тяжести; ** - Тяжелый гестоз
Рисунок 21 - Распределение частот гаплотипов гена ACVR2A у пациенток с гестозом и в контрольной группе в русской и якутской популяции
Рисунок 22 - Распределение частот гаплотипов гена LEP у пациенток с гестозом и в контрольной группе в русской и якутской популяции
Кроме того, был проведен анализ распределения частот гаплотипов между пациентками с гестозом различной степени тяжести и контрольной группой в различных этнических выборках. Статистических различий по гену ACVR2A не было показано ни для одной из изученных популяций. Анализ частот гаплотипов гена LEP Показал статистически значимые отличия распределения между группой здоровых и пациенток с гестозом легкой и средней степени только для популяции русских. Частота гаплотипа AGCTA была выше в группе больных по сравнеию с данным показателем в группе здоровых (ч2=6,36; p=0,01; OR=3,59; Cl: 1,14 - 11,6). Также были установлены статистически зачимые отличия между больными гестозом тяжелой формы и контрольной группой в популяции русских и якутов. Среди женщин, принадлежащих к этнической группе русских, у больных было отмечено повышение частоты гаплотипа AGCTA (ч2=10,42; p=0,001; OR=4,48; Cl: 1,55 - 13,51). В якутской популяции у пациенток с тяжелой формой гестоза статистически значимо повышены частоты гаплотипов GGTCA (ч2=4,01; p=0,04; OR=2,08; Cl: 0,95 - 4,57) и GGCCG (ч2=15,52; p=0,00008; OR - не определен).
Полиморфизмы, которые возникли вследствие мутаций, как правило, имеют определенную биологическую значимость относительно приспособления к условиям окружающей среды и вследствие этого они распространились путем природного отбора с частотой не менее 1% в пределах определенной этнической или географической группы населения, которая характеризуется отличными от других условиями существования и жизнедеятельности. Поскольку однонуклеотидные полиморфизмы могут отвечать за наличие качественно новых свойств организма, то частота их распространения будет отличаться между различными этническими или географическими группами, соответственно определенным условиям жизнедеятельности конкретной популяции.
Таким образом, получены доказательства вовлеченности полиморфных вариантов гена LEP В молекулярные механизмы развития гестоза как на уровне генотипов, так и на гаплотипическом уровне. Нами показана ассоциация с гестозом трех гаплотипов гена LEP: два из которых(GGTCA и GGCCG) значительно повышают риск развития данной патологии в тяжелой форме среди женщин, принадлежащих к этнической группе якутов и один (AGCTA) повышает риск развития гестоза как легкой и средней, так и тяжелой формы гестоза у женщин из популяции русских. При анализе частот гаплотипов гена ACVR2A Не найдена ассоциация с гестозом различной стпени тяжести во всех изученных группах.
Таким образом, полученные в настоящей работе данные по изучению полиморфных вариантов генов LEP и ACVR2A в популяциях русских, и якутов дополняют сведения о вариабельности этих генов и могут служить основой для дальнейших исследований роли генов LEP и ACVR2A в подверженности к гестозам и другим мультифакториальным состояниям.
Похожие статьи
-
Распределение частот аллелей и генотипов, а также соответствие распределения генотипов равновесию Харди-Вайнберга, полученные в данном исследовании,...
-
Клиническая характеристика обследованных пациенток Всего были обследованы 657 беременных женщин из двух популяций: якуты (г. Якутск) N = 340 и русские...
-
В настоящей работе также был проведен сравнительный анализ частот генотипов и аллелей полиморфизмов генов LEP и ACVR2A междеу контрольными группами и...
-
Ранняя диагностика и своевременная профилактика различных заболеваний являются одной из наиболее актуальных проблем современной медицины. Самую...
-
Полногеномный анализ ассоциаций tagSNPs с преэклампсией GWAS (Genom-wide association study) - полногеномный анализ ассоциаций позволяет выявить множество...
-
Одной из актуальных проблем современного акушерства является проблема гестоза [5]. Показатели материнской смертности в мировой практике весьма стабильны...
-
Прогресс технологии генотипирования и разработка современных статистических методов предоставили новые возможности для изучения роли вариабельности...
-
1) Провести анализ ассоциаций генотипов и аллелей исследованных полиморфизмов с гестозом в популяциях русских и якутов. 2) Оценить ассоциации...
-
Статистическая обработка результатов исследования проводилась с помощью пакета статистических программ "Statistica 6.0". Различие двух сравниваемых...
-
Согласно одному из распостраненных определений, гестоз представляет собой синдром полиорганной недостаточности, возникающей при беременности, в основе...
-
Согласно современным исследованиям последних лет, генетическая компонента гестоза может составлять 50%. Изучение генетических маркеров, ассоциированных с...
-
В данной работе исследовано 9 полиморфных вариантов 2 кандидатных генов подверженности к гестозу: рецептора активина 2 типа (ACVR2A) и лептина (LEP) . В...
-
Семейный анализ сцепления Для гестоза полный геномный поиск (Genom-wide linkage studies) был проведен для пяти популяций на материале мультиплексных...
-
Лептин - гормон (белок 16 кДа), регулирующий энергитический обмен, оказывающий анорексигенное действие (рис. 6). Секретируется адипоцитами, клетками...
-
Клеточный сигнальный белок активин А - член суперсемейства сигнальных белков, таких как TGF-b (рис. 4). Роль этих белков была описана в различных...
-
Международный проект HapMap был создан и стартовал в 2002 году усилиями многих стран с целью каталогизировать индивидуальные генетические особенности...
-
Выделение ДНК из лейкоцитов венозной крови Выделение ДНК проводили стандартным методом с использованием фенол-хлороформной очистки [98, 120]. К 0.7 мл...
-
Одним из активно разрабатываемых направлений с применением технологии микрочипов является исследование транскрипционных профилей при сложных...
-
Оценка случайного инбридинга методом изонимии - Методы исследования популяции человека
Фамилия - основная часть триединого полного русского именования человека - является очень интересным словом, которое может расцениваться и как памятник...
-
Нами была проведена сравнительная оценка различных механизмов персистенции вируса в организме гусениц непарного шелкопряда и условия ее перехода в острое...
-
Введение - Популяция как элементарная единица эволюции
Все виды живых организмов в природе представлены совокупностями особей - популяциями. Популяции - такие же природные реальности, как клетки с кодами их...
-
1) [-]сердце двухкамерное, два круга кровообращения 2) [-]сердце трубчатое 3) [+]один круг кровообращения, двухкамерное сердце 4) [-]сердце трехкамерное,...
-
Биологическими маркерами принято считать устойчивые биохимические, физиологические, анатомические и иные признаки организмов, варьирующие в норме в...
-
Генетико-демографическая характеристика популяций - Методы исследования популяции человека
Демографические параметры, витальные статистики и индекс Кроу и его компоненты, позволяют оценить интенсивность естественного отбора в популяции и...
-
Популяция - элементарная единица эволюции - Популяция как элементарная единица эволюции
Отдельные особи, не имеют собственной эволюционной судьбы, потому что все эволюционные события осуществляются при смене поколений. Вид, подвид, группы из...
-
Иммуноферментный анализ - Производство биоферментных препаратов
Иммуноферментный анализ - это новый метод анализа, который используется с целью контроля в продуктах питания микотоксинов, гормонов, а также...
-
Груз наследственных заболеваний является составной частью общего генетического груза популяций. Оценка отягощенности наследственной патологии в...
-
Фитоценотический анализ флоры - Синантропная флора Дальнего Засвияжья г. Ульяновска
Таблица № 4. Фитоценотический спектр изучаемой флоры № Фитоценотическая группа Число видов % от общего числа видов 1 Культурценозы 104 38,1 % 2...
-
Мутации, Естественный отбор - Генетические процессы в популяциях
Мутации являются одним из стохастических факторов, влияющих на равновесие генных частот в популяции. Мутации возникают постоянно и приводят к появлению...
-
Популяция - единица эволюции - Сущность эволюционной теории Чарльза Дарвина
Особи любого вида распространены в пределах ареала неравномерно, как бы островами, то есть густонаселенные участки сменяются редконаселенными. В...
-
Генетический дрейф - Генетические процессы в популяциях
Изучение природных популяций показывает, что, как правило, они не представляют собой единой панмиксной единицы. Подразделенность большой популяции на...
-
Факторы популяционной динамики, Инбридинг - Генетические процессы в популяциях
Инбридинг Понятие "инбридинг" широко используется в популяционной генетике при описании особенностей генетической структуры популяций. Случайное...
-
Основной закон популяционной генетики - Генетические процессы в популяциях
Закон Харди-Вайнберга -- это ключевая закономерность популяционной генетики. Этот закон можно сформулировать следующим образом: в популяции бесконечно...
-
"Обзорный" метод - Методы исследования популяции человека
Наиболее полноценным методом проведения популяционно-генетических исследований является "обзорный". Данный метод позволяет проводить обследование и...
-
Генетические регистры - Методы исследования популяции человека
Определение распространенности максимально возможного числа нозологических форм наследственных заболеваний в популяции, возможно, путем создания...
-
Статистические методы - Методы исследования популяции человека
Статистика Нея На основании данных о численностях фенотипов рассчитывают частоты соответствующих аллелей всех исследованных полиморфных систем, величину...
-
Важное значение имеет биоморфологический анализ, позволяющий выявить разнообразие жизненных форм видов, составляющих изучаемую флору. Во многих работах...
-
Полиморфные белки - Методы исследования популяции человека
Изучая генетическую структуру населения определенного региона проводятся исследования генетико-биохимического полиморфизма систем транспортных белков...
-
Процесс саморегуляции в дубраве проявляется в том, что все разнообразное население леса существует совместно, не уничтожая полностью друг друга, а лишь...
-
Введение - Современная теория эволюции
Эволюция происходит в течение периода времени, превышающего срок жизни одного поколения, и заключается в изменении наследуемых черт организма. Первым...
Анализ распределения частот гаплотипов генов LEP и ACVR2A в исследованных группах - Анализ ассоциаций tagSNPs и гаплотипов генов LEP и ACVR2A с развитием гестоза в популяциях русских и якутов