Методы статистической обработки результатов - Анализ ассоциаций tagSNPs и гаплотипов генов LEP и ACVR2A с развитием гестоза в популяциях русских и якутов
Статистическая обработка результатов исследования проводилась с помощью пакета статистических программ "Statistica 6.0". Различие двух сравниваемых величин считалось статистически значимым с надежностью р > 0,95, если вероятность их тождества оказывалась меньше 5%.
Соответствие распределения частот аллелей и генотипов по исследованным генам равновесию Харди-Вайнберга проверяли по критерию 2 [17]:
2= ?( NФ - NТ )2/ NФ,
Где Nт - теоретически ожидаемая численность генотипов
Nф - фактическая численность генотипов
K= m(m-1)/2, где m - число аллелей
Для сравнения частот аллелей у больных с контролем и с популяционной выборкой проводили попарное сравнение выборок.
2= N1N2(p1-p2)2/NP(1-p) ,
Где p =(p1N1+p2N2)/N - средневзвешенная частота аллеля,
И N1 и N2 - численность аллелей в сравниваемых выборках,
Р1 и р2 - частоты аллелей в этих же выборках.
В исследуемых группах для полиморфных вариантов вычисляли отношение шансов (OR) и доверительные интервалы (Cl) для отношения шансов (95% Cl).
Частоты гаплотипов определялись с помощью EM-алгоритма. LD между парами SNPs оценивалось с помощью коэффициента D', предложенного Левонтином и коэффициента корреляции r2 Пирсона.
Коэффициент D' Левонтина рассчитывают по формуле:
D' = D / |D|max [1; -1],
Где DIj = hIj - pIQJ - коэффициент неравновесия, hIj - оценка частоты гаметы АIВJ в популяции, pI И qJ - оценки частот аллелей АI И ВJ соответственно.
Коэффициент корреляции r2 Пирсона рассчитывают по формуле:
R2 = D2 / pIQIPJQJ
Похожие статьи
-
1) Провести анализ ассоциаций генотипов и аллелей исследованных полиморфизмов с гестозом в популяциях русских и якутов. 2) Оценить ассоциации...
-
Прогресс технологии генотипирования и разработка современных статистических методов предоставили новые возможности для изучения роли вариабельности...
-
В данной работе исследовано 9 полиморфных вариантов 2 кандидатных генов подверженности к гестозу: рецептора активина 2 типа (ACVR2A) и лептина (LEP) . В...
-
Согласно одному из распостраненных определений, гестоз представляет собой синдром полиорганной недостаточности, возникающей при беременности, в основе...
-
Выделение ДНК из лейкоцитов венозной крови Выделение ДНК проводили стандартным методом с использованием фенол-хлороформной очистки [98, 120]. К 0.7 мл...
-
Клеточный сигнальный белок активин А - член суперсемейства сигнальных белков, таких как TGF-b (рис. 4). Роль этих белков была описана в различных...
-
Семейный анализ сцепления Для гестоза полный геномный поиск (Genom-wide linkage studies) был проведен для пяти популяций на материале мультиплексных...
-
Ранняя диагностика и своевременная профилактика различных заболеваний являются одной из наиболее актуальных проблем современной медицины. Самую...
-
Одним из активно разрабатываемых направлений с применением технологии микрочипов является исследование транскрипционных профилей при сложных...
-
Клиническая характеристика обследованных пациенток Всего были обследованы 657 беременных женщин из двух популяций: якуты (г. Якутск) N = 340 и русские...
-
Лептин - гормон (белок 16 кДа), регулирующий энергитический обмен, оказывающий анорексигенное действие (рис. 6). Секретируется адипоцитами, клетками...
-
Полногеномный анализ ассоциаций tagSNPs с преэклампсией GWAS (Genom-wide association study) - полногеномный анализ ассоциаций позволяет выявить множество...
-
Согласно современным исследованиям последних лет, генетическая компонента гестоза может составлять 50%. Изучение генетических маркеров, ассоциированных с...
-
Международный проект HapMap был создан и стартовал в 2002 году усилиями многих стран с целью каталогизировать индивидуальные генетические особенности...
-
Статистические методы - Методы исследования популяции человека
Статистика Нея На основании данных о численностях фенотипов рассчитывают частоты соответствующих аллелей всех исследованных полиморфных систем, величину...
-
Определение активности церулоплазмина. Активность Цп определяли по методу Тэна Э. В. (175). В пробирку вносили 0,1 мл сыворотки крови, 1 мл 0,4М...
-
Полиморфные белки - Методы исследования популяции человека
Изучая генетическую структуру населения определенного региона проводятся исследования генетико-биохимического полиморфизма систем транспортных белков...
-
Биологическими маркерами принято считать устойчивые биохимические, физиологические, анатомические и иные признаки организмов, варьирующие в норме в...
-
Факторы популяционной динамики, Инбридинг - Генетические процессы в популяциях
Инбридинг Понятие "инбридинг" широко используется в популяционной генетике при описании особенностей генетической структуры популяций. Случайное...
-
Степень выраженности каждой из полиструктурных ценностных ориентации личности определялась с помощью ключа, представленного в бланке ответов....
-
Окрашивание корней производилось по следующему методу [Trouvelot, Kough, Gianinazzi-Pearson, 1986, с. 217-221]: 1. Отбирали корни 10-20 шт. с одного...
-
"Обзорный" метод - Методы исследования популяции человека
Наиболее полноценным методом проведения популяционно-генетических исследований является "обзорный". Данный метод позволяет проводить обследование и...
-
Скринирующие программы - Методы исследования популяции человека
Государственные скринирующие программы на наследственные болезни обмена у новорожденных, один из примеров подобных исследований. Первый этап скрининга...
-
ДНК-маркеры - Методы исследования популяции человека
Для изучения структуры генофонда и этногенеза современных популяций человека в качестве первых молекулярно-генетических маркеров стали использовать...
-
Оценка случайного инбридинга методом изонимии - Методы исследования популяции человека
Фамилия - основная часть триединого полного русского именования человека - является очень интересным словом, которое может расцениваться и как памятник...
-
Программа исследования Исследование проводилось в три этапа. На первом этапе проводился сбор и обработка информации. На втором этапе проводился анализ...
-
Исследования полостных или трубчатых органов, заключающиеся в непосредственном осмотре их внутренней поверхности с помощью особых приборов - Эндоскопов...
-
Материал и методы исследования - Фауна рыб нижнего течения реки Гайва
Материал для данной работы был собран на р. Гайва Пермского края в весеннее-летне-осенний период с 6 мая по 11 сентября 2015 года, как во время...
-
Для анализа масс-спектральных белковых профилей культуры выращивали на среде R2A (28С,48 ч). Клетки (~ одну колонию) переносили с помощью тонкого...
-
Основные методы, которые были использованы при исследовании видов рода Amanita Fr. - это среднемасштабный маршрутный метод исследования микобиоты и...
-
Материал исследования Исследования проводили в период вегетативного сезона 2011-2015 гг. Сбор осуществляли преимущественно маршрутным методом. В ходе...
-
Методы выявления биопленок - Использование микробных биопленок в промышленности
В настоящее время наиболее надежным методом подтверждения наличия микробной биопленки является специальная микроскопия. В первую очередь это конфокальное...
-
Цель исследования - провести эпидемиологический анализ заболеваемости дизентерией в Железнодорожном районе г. Рязань с получением всех данных для...
-
Цель обработки результатов: получение индекса эмпатийности испытуемого. Чтобы получить индекс эмпатийности, нужно подсчитать количество ответов,...
-
Чтобы определить уровень своей самооценки, нужно сложить все баллы по утверждениям. А теперь подсчитайте, каков общий суммарный балл. Уровни самооценки:...
-
Распределите баллы согласно таблицам (цифры в разделах - номера соответствующих утверждениях). Профессиональные Финансовые Семейныеые Социальные...
-
Не существует таких явлений природы, технических или социальных процессов, которые были бы предметом изучения математики, но при этом не относились бы к...
-
Груз наследственных заболеваний является составной частью общего генетического груза популяций. Оценка отягощенности наследственной патологии в...
-
МОСКИТЫ - семейство Psychodidae. Подсемейство Phlebotominae, роды: Phlebotomus, Sergentomiyia, Lutzomyia, Brumtomya, Warileya. Взрослые самки питаются...
-
"Наша способность к самообмену по поводу работы собственного мозга почти безгранична главным образом потому, что часть, о которой мы можем сообщить,...
Методы статистической обработки результатов - Анализ ассоциаций tagSNPs и гаплотипов генов LEP и ACVR2A с развитием гестоза в популяциях русских и якутов