Анализ ассоциаций изученных tagSNPs генов LEP и ACVR2A с развитием отдельных клинических форм гестоза. - Анализ ассоциаций tagSNPs и гаплотипов генов LEP и ACVR2A с развитием гестоза в популяциях русских и якутов
В настоящей работе также был проведен сравнительный анализ частот генотипов и аллелей полиморфизмов генов LEP и ACVR2A междеу контрольными группами и группами пациенток с гестозом различной степени тяжести в популяциях русских и якутов. Результаты приведены в таблицах 6 и 7.
Таблица 6 - Распределение частот генотипов и аллелей по исследованным полиморфизмам генов LEP и ACVR2A в популяции русских
Исследуемые полиморфизмы (гены) |
Гестоз тяжелый N=86 |
Гестоз легкой и средней степени тяжести N=74 |
Контроль N=160 | ||
Rs 2167270(LEP) |
Частоты генотипов, % |
AA |
17,2 |
16,2 |
8,8 |
AG |
46,0 |
26,5 |
35,6 | ||
GG |
36,8 |
57,4 |
55,6 | ||
Частота аллеля, % |
A |
40,2 |
29,4 |
26,6 | |
Уровень значимости р для критерия ч^2 с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=9,08 Р=0,01 |
Ч2=3,64 Р=0,016 | ||
Для аллелей |
Ч2=9,87 P=0,002 |
Ч2=0,39 P=0,53 | |||
Rs 2278815 (LEP) |
Частоты генотипов, % |
AA |
20,9 |
39,7 |
28,8 |
AG |
51,2 |
39,7 |
48,1 | ||
GG |
27,9 |
20,6 |
23,1 | ||
Частота аллеля, % |
G |
53,5 |
40,4 |
47,2 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=1,94 P=0,38 |
Ч2=2,67 P=0,26 | ||
Для аллелей |
Ч2=1,78 P=0,18 |
Ч2=1,75 P=0,12 | |||
Rs 11763517(LEP) |
Частоты генотипов, % |
СС |
29,9 |
19,7 |
17,0 |
CT |
37,7 |
45,5 |
51,6 | ||
TT |
32,5 |
34,8 |
31,4 | ||
Частота аллеля, % |
T |
51,3 |
57,6 |
57,2 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=6,22 P=0,004 |
Ч2=0,71 P=0,7 | ||
Для аллелей |
Ч2=1,48 P=0,22 |
Ч2=0,0 P=0,95 | |||
Rs 2071045(LEP) |
Частоты генотипов, % |
СС |
2,4 |
1,5 |
5,2 |
CT |
37,6 |
32,4 |
35,1 | ||
TT |
60,2 |
66,2 |
59,7 | ||
Частота аллеля, % |
T |
78,9 |
82,4 |
77,3 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=1,07 P=0,58 |
Ч2=2,03 P=0,36 | ||
Для аллелей |
Ч2=0,17 P=0,68 |
Ч2=1,46 P=0,23 | |||
Rs 3828942 (LEP) |
Частоты генотипов, % |
AA |
28,4 |
23,9 |
21,4 |
AG |
49,4 |
70,1 |
50,3 | ||
GG |
21,2 |
6,0 |
28,3 | ||
Частота аллеля, % |
G |
45,9 |
41,0 |
53,5 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=2,57 P=0,28 |
Ч2=14,28 P=0,0008 | ||
Для аллелей |
Ч2=2,54 P=0,11 |
Ч2=5,81 P=0,002 | |||
Rs 1014064 (ACVR2A) |
Частоты генотипов, % |
AA |
37,3 |
38,2 |
45,0 |
AG |
47,0 |
42,6 |
41,6 | ||
GG |
15,7 |
19,1 |
13,4 | ||
Частота аллеля, % |
G |
39,2 |
40,4 |
34,2 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=1,27 P=0,53 |
Ч2=1,5 P=0,47 | ||
Для аллелей |
Ч2=1,12 P=0,29 |
Ч2=1,56 P=0,21 | |||
Rs 17742342 (ACVR2A) |
Частоты генотипов, % |
AA |
59,8 |
75,0 |
75,0 |
AC |
39,1 |
25,0 |
25,0 | ||
CC |
1,1 |
0,0 |
0 | ||
Частота аллеля, % |
C |
20,7 |
12,5 |
12,5 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=7,45 P=0,02 |
Ч2=0,0 P=1 | ||
Для аллелей |
Ч2=5,81 P=0,02 |
Ч2=0,0 P=1 | |||
Rs 2161984 (ACVR2A) |
Частоты генотипов, % |
AA |
11,9 |
19,7 |
12,8 |
AG |
48,8 |
37,9 |
41,6 | ||
GG |
39,3 |
42,4 |
45,6 | ||
Частота аллеля, % |
A |
36,3 |
38,6 |
33,6 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=1,16 P=0,56 |
Ч2=1,75 P=0,42 | ||
Для аллелей |
Ч2=0,36 P=0,55 |
Ч2=1,04 P=0,31 | |||
Rs 10497025 (ACVR2A) |
Частоты генотипов, % |
CC |
50,0 |
53,0 |
57,2 |
CG |
41,7 |
34,8 |
35,5 | ||
GG |
8,3 |
12,1 |
7,2 | ||
Частота аллеля, % |
G |
19,2 |
29,5 |
25,0 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=1,14 P=0,56 |
Ч2=1,41 P=0,49 | ||
Для аллелей |
Ч2=0,96 P=0,33 |
Ч2=0,98 P=0,32 |
Примечание: N - количество индивидов в группе. * - значение критерия 2 с поправкой Йейтса и уровень значимости р получены при сравнении частот аллелей или генотипов контрольной группы и группы больных гестозом. Жирным шрифтом выделены статистически значимые различия (р<0,05).
Таблица 7 - Распределение частот генотипов и аллелей по исследованным полиморфизмам генов LEP и ACVR2A в популяции якутов
Исследуемые полиморфизмы (гены) |
Гестоз тяжелый N=95 |
Гестоз легкой и средней степени тяжести N=115 |
Контроль N=130 | ||
Rs 2167270(LEP) |
Частоты генотипов, % |
AA |
6,2 |
10,8 |
10,8 |
AG |
36,7 |
28,5 |
28,5 | ||
GG |
57,2 |
60,7 |
60,8 | ||
Частота аллеля, % |
A |
24,5 |
28,0 |
25,5 | |
Уровень значимости р для критерия ч^2 с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=0,02 Р=0,9 |
Ч2=7,33 Р=0,03 | ||
Для аллелей |
Ч2=2,69 P=0,26 |
Ч2=1,25 P=0,26 | |||
Rs 2278815 (LEP) |
Частоты генотипов, % |
AA |
38,9 |
48,3 |
55,7 |
AG |
43,2 |
39,0 |
30,3 | ||
GG |
17,9 |
12,7 |
13,9 | ||
Частота аллеля, % |
G |
39,5 |
32,2 |
29,1 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=6,09 P=0,05 |
Ч2=2,0 P=0,37 | ||
Для аллелей |
Ч2=5,15 P=0,02 |
Ч2=0,54 P=0,46 | |||
Rs 11763517(LEP) |
Частоты генотипов, % |
СС |
5,9 |
2,6 |
17,0 |
CT |
18,8 |
25,9 |
51,6 | ||
TT |
75,3 |
71,5 |
31,4 | ||
Частота аллеля, % |
T |
84,7 |
84,5 |
57,2 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=2,89 P=0,24 |
Ч2=0,01 P=0,99 | ||
Для аллелей |
Ч2=0,0 P=0,99 |
Ч2=0,0 P=0,95 | |||
Rs 2071045(LEP) |
Частоты генотипов, % |
СС |
44,8 |
39,3 |
5,2 |
CT |
37,9 |
46,2 |
35,1 | ||
TT |
17,2 |
14,5 |
59,7 | ||
Частота аллеля, % |
T |
36,2 |
37,6 |
77,3 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=3,62 P=0,16 |
Ч2=0,96 P= 0,62 | ||
Для аллелей |
Ч2=1,21 P=0,27 |
Ч2=1,46 P=0,23 | |||
Rs 3828942 (LEP) |
Частоты генотипов, % |
AA |
57,3 |
56,9 |
21,4 |
AG |
38,5 |
38,8 |
50,3 | ||
GG |
4,2 |
4,3 |
28,3 | ||
Частота аллеля, % |
G |
23,4 |
23,7 |
53,5 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=0,71 P=0,7 |
Ч2=0,83 P=0,66 | ||
Для аллелей |
Ч2=0,01 P=0,92 |
Ч2=0,03 P=0,86 | |||
Rs 1014064 (ACVR2A) |
Частоты генотипов, % |
AA |
37,5 |
40,8 |
45,0 |
AG |
50,0 |
48,3 |
41,6 | ||
GG |
12,5 |
10,8 |
13,4 | ||
Частота аллеля, % |
G |
37,0 |
35,0 |
34,2 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=0,14 P=0,93 |
Ч2=0,91 P=0,63 | ||
Для аллелей |
Ч2=0,1 P=0,75 |
Ч2=0,84 P=0,36 | |||
Rs 17742342 (ACVR2A) |
Частоты генотипов, % |
AA |
90,3 |
93,3 |
75,0 |
AC |
9,7 |
6,7 |
25,0 | ||
CC |
0,0 |
0,0 |
0 | ||
Частота аллеля, % |
C |
4,8 |
3,4 |
12,5 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=0,33 P=0,85 |
Ч2=2,04 P=0,36 | ||
Для аллелей |
Ч2=0,31 P=0,58 |
Ч2=1,94 P=0,37 | |||
Rs 2161984 (ACVR2A) |
Частоты генотипов, % |
AA |
14,0 |
10,2 |
12,8 |
AG |
47,3 |
46,6 |
41,6 | ||
GG |
38,7 |
43,2 |
45,6 | ||
Частота аллеля, % |
A |
37,6 |
33,5 |
33,6 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=0,28 P=0,87 |
Ч2=1,97 P=0,37 | ||
Для аллелей |
Ч2=0,17 P=0,68 |
Ч2=1,88 P=0,17 | |||
Rs 10497025 (ACVR2A) |
Частоты генотипов, % |
CC |
88,0 |
84,5 |
57,2 |
CG |
12,0 |
11,2 |
35,5 | ||
GG |
0 |
4,3 |
7,2 | ||
Частота аллеля, % |
G |
6,0 |
9,9 |
25,0 | |
Уровень значимости р для критерия с поправкой Йейтса,* |
Для генотипов |
Ч2=1,59 P=0,45 |
Ч2=3,29 P=0,19 | ||
Для аллелей |
Ч2=1,25 P=0,26 |
Ч2=0,12 P=0,73 |
Примечание: N - количество индивидов в группе. * - значение критерия 2 с поправкой Йейтса и уровень значимости р получены при сравнении частот аллелей или генотипов контрольной группы и группы больных гестозом. Жирным шрифтом выделены статистически значимые различия (р<0,05).
При сравнительном анализе частот аллелей и генотипов по изученным полиморфизмам генов LEP и ACVR2A между больными гестозом разной степени тяжести и контрольной группы были установлены статистически значимые отличия в популяции русских по полиморфизмам rs3828942, rs2167270 гена LEP (рис. 18, 19) и rs17742342 гена ACVR2A (рис. 20). Показано, что носительство предкового аллеля G (OR=0,61; Cl: 0,40 - 0,91 ) и варианта GG (OR=0,16; Cl: 0,06 - 0,47 ) обладает протективным эффектом относительно гестоза легкой и средней степени тяжести, а алель А(OR=2,17; Cl: 0,99 - 4,74 ) и генотип АА (OR=1,86; Cl: 1,26 - 2,75)rs2167270 (LEP), а так же аллель С (OR=5,57; Cl: 0,22 - 138,12) и генотип СС (OR=1,83; Cl: 1,11 - 2,99) rs17742342 (ACVR2A) значительно повышают риск развития гестоза тяжелой формы.
Рисунок 18 - Распределение частот аллелей и генотипов rs3828942 (LEP) у пациенток с легкой и средней степени тяжести гестозом и у женщин с физиологической беременностью из популяции русских.
Примечание: * отмечены статистически значимые отличия
Рисунок 19 - Распределение частот аллелей и генотипов rs2167270 (LEP) у пациенток с тяжелой формой, легкой и средней степени тяжести гестозом и у женщин с физиологической беременностью из популяции русских
Примечание: * отмечены статистически значимые отличия
Рисунок 20 - Распределение частот аллелей и генотипов rs17742342 (ACVR2A) у пациенток с тяжелой, легкой и средней степени тяжести гестозом и у женщин с физиологической беременностью из популяции русских.
Примечание: * отмечены статистически значимые отличия
Лептин циркулирует в крови в виде свободного гормона или в связанном состоянии, в основном с экстрацеллюлярной частью растворимого рецептора лептина (LEPR). Рецепторы лептина присутствуют не только в гипоталамусе, но и в периферических органах и тканях (жировой печени, скелетной мускулатуре, поджелудочной железе, яичниках, предстательной железе, плаценте, почках, легких). Показано, что точечные мутации в гене рецептора к лептину приводят к нарушению сплайсинга и блокируют экспрессию длинной формы рецептора [148]. При такой мутации рецептора нарушается проведение гормонального сигнала. Единичная точечная замена (полиморфизм Gln223Arg) гена LEPR приводит к аминокислотной замене и, как следствие, к изменению функциональных особенностей рецептора [122]. В работе J. Rigo и др. оценивали связь полиморфизма LEPR Gln223Arg у женщин с диагнозом "преэклампсия" [122].
GWLS в семьях из Австралии, Новой Зеландии, и Исландии позволили установить локус, отвечающий за развитие преэклампсии, на хромосоме 2q22-23[112, 113, 68].Таким образом ACVR2A был описан как предпологаемый ген кандидат. Также в нескольких исследованиях было установлено, что преэклампсия связана с повышением уровня активина в сыворотке крови матери. Исходя из этих данных было выдвинуто предположение, что дисбаланс экспрессии ACVR2A может влиять на концентрацию активина и следовательно на такие процессы как инвазия трофобласта и ремодернизация спиральных артерий[88, 112, 113]. Дисбаланс экспрессии рецептора, а именно, снижение экспрессии ACVR2A может вызвать повышение урованя активина в сыворотке крови. Гипотетически, именно этот механизм приводит к нарушению работы иммунной системы, а следовательно к разбалансировке работы противовоспалительного звена[133].
Похожие статьи
-
Распределение частот аллелей и генотипов, а также соответствие распределения генотипов равновесию Харди-Вайнберга, полученные в данном исследовании,...
-
Клиническая характеристика обследованных пациенток Всего были обследованы 657 беременных женщин из двух популяций: якуты (г. Якутск) N = 340 и русские...
-
Статистическая обработка результатов исследования проводилась с помощью пакета статистических программ "Statistica 6.0". Различие двух сравниваемых...
-
Прогресс технологии генотипирования и разработка современных статистических методов предоставили новые возможности для изучения роли вариабельности...
-
Клеточный сигнальный белок активин А - член суперсемейства сигнальных белков, таких как TGF-b (рис. 4). Роль этих белков была описана в различных...
-
1) Провести анализ ассоциаций генотипов и аллелей исследованных полиморфизмов с гестозом в популяциях русских и якутов. 2) Оценить ассоциации...
-
Лептин - гормон (белок 16 кДа), регулирующий энергитический обмен, оказывающий анорексигенное действие (рис. 6). Секретируется адипоцитами, клетками...
-
Международный проект HapMap был создан и стартовал в 2002 году усилиями многих стран с целью каталогизировать индивидуальные генетические особенности...
-
Одной из актуальных проблем современного акушерства является проблема гестоза [5]. Показатели материнской смертности в мировой практике весьма стабильны...
-
Полногеномный анализ ассоциаций tagSNPs с преэклампсией GWAS (Genom-wide association study) - полногеномный анализ ассоциаций позволяет выявить множество...
-
Ранняя диагностика и своевременная профилактика различных заболеваний являются одной из наиболее актуальных проблем современной медицины. Самую...
-
Согласно современным исследованиям последних лет, генетическая компонента гестоза может составлять 50%. Изучение генетических маркеров, ассоциированных с...
-
Выделение ДНК из лейкоцитов венозной крови Выделение ДНК проводили стандартным методом с использованием фенол-хлороформной очистки [98, 120]. К 0.7 мл...
-
Семейный анализ сцепления Для гестоза полный геномный поиск (Genom-wide linkage studies) был проведен для пяти популяций на материале мультиплексных...
-
В данной работе исследовано 9 полиморфных вариантов 2 кандидатных генов подверженности к гестозу: рецептора активина 2 типа (ACVR2A) и лептина (LEP) . В...
-
Согласно одному из распостраненных определений, гестоз представляет собой синдром полиорганной недостаточности, возникающей при беременности, в основе...
-
Одним из активно разрабатываемых направлений с применением технологии микрочипов является исследование транскрипционных профилей при сложных...
-
Полиморфные белки - Методы исследования популяции человека
Изучая генетическую структуру населения определенного региона проводятся исследования генетико-биохимического полиморфизма систем транспортных белков...
-
Биологическими маркерами принято считать устойчивые биохимические, физиологические, анатомические и иные признаки организмов, варьирующие в норме в...
-
Основной закон популяционной генетики - Генетические процессы в популяциях
Закон Харди-Вайнберга -- это ключевая закономерность популяционной генетики. Этот закон можно сформулировать следующим образом: в популяции бесконечно...
-
Факторы популяционной динамики, Инбридинг - Генетические процессы в популяциях
Инбридинг Понятие "инбридинг" широко используется в популяционной генетике при описании особенностей генетической структуры популяций. Случайное...
-
ДНК-маркеры - Методы исследования популяции человека
Для изучения структуры генофонда и этногенеза современных популяций человека в качестве первых молекулярно-генетических маркеров стали использовать...
-
Звуки преследуют нас всегда, и спастись от них невозможно, потому что матушка-природа об этом, увы, не позаботилась. Кстати, приятные звуки человеческому...
-
Клинический диагноз и его обоснование - Вирусный гепатит
С учетом предварительного диагноза и дополнительных методов исследования ставим клинический диагноз: Вирусный гепатит А. Желтушная форма. Средняя степень...
-
Оценка случайного инбридинга методом изонимии - Методы исследования популяции человека
Фамилия - основная часть триединого полного русского именования человека - является очень интересным словом, которое может расцениваться и как памятник...
-
В настоящее время оценка генетической структуры различных популяций осуществляется с использование биологических и небиологических источников информации,...
-
Многолетняя динамика заболеваемости дизентерией в Железнодорожном районе г. Рязани. При оценке многолетней динамики заболеваемости исходят из того, что...
-
Мутации, Естественный отбор - Генетические процессы в популяциях
Мутации являются одним из стохастических факторов, влияющих на равновесие генных частот в популяции. Мутации возникают постоянно и приводят к появлению...
-
Миграции - Генетические процессы в популяциях
Равновесие генных частот в популяции предполагается при отсутствии миграций. Наряду с этим, между реально существующими популяциями человека постоянно...
-
Генетико-демографическая характеристика популяций - Методы исследования популяции человека
Демографические параметры, витальные статистики и индекс Кроу и его компоненты, позволяют оценить интенсивность естественного отбора в популяции и...
-
Статистические методы - Методы исследования популяции человека
Статистика Нея На основании данных о численностях фенотипов рассчитывают частоты соответствующих аллелей всех исследованных полиморфных систем, величину...
-
Популяция - элементарная единица эволюции - Популяция как элементарная единица эволюции
Отдельные особи, не имеют собственной эволюционной судьбы, потому что все эволюционные события осуществляются при смене поколений. Вид, подвид, группы из...
-
Причины утомления: 1. В организме - 2. В мышце - в мышце во время сокращения накапливаются продукты обмена веществ (фосфорная кислота, молочная), которые...
-
Регуляция после транскрипции, Моноаллельная экспрессия генов - Экспрессия генов
МикроРНК -- это короткие (18--25 нуклеотидов) последовательности односпиральной РНК, вызывают подавление экспрессии генов. МикроРНК связываются со своей...
-
Классификация мутаций - Мутация
1. По способу возникновения. Различают спонтанные и индуцированные мутации Спонтанные происходят в природе крайне редко с частотой 1-100 на миллион...
-
Бронхиальная астма, эндогенная форма, тяжелое течение, обострение средней степени тяжести; хронический обструктивный бронхит средней степени тяжести,...
-
Нами была проведена сравнительная оценка различных механизмов персистенции вируса в организме гусениц непарного шелкопряда и условия ее перехода в острое...
-
КЛИНИЧЕСКИЙ ДИАГНОЗ: ОСНОВНОЕ ЗАБОЛЕВАНИЕ: Острый панкреатит, отечная форма. СОПУТСТВУЮЩЕЕ ЗАБОЛЕВАНИЕ: Язвенная болезнь луковицы ДПК, стадия ремиссии,...
-
Груз наследственных заболеваний является составной частью общего генетического груза популяций. Оценка отягощенности наследственной патологии в...
-
4) Анализ Мочи: 28.11.09 Цвет соломенно-желтый Прозрачность неполная Удельный вес 1.025 Белок 0.4944 Глюкоза - -- Лейкоциты 1-2 в п/зр Гиалиновые...
Анализ ассоциаций изученных tagSNPs генов LEP и ACVR2A с развитием отдельных клинических форм гестоза. - Анализ ассоциаций tagSNPs и гаплотипов генов LEP и ACVR2A с развитием гестоза в популяциях русских и якутов