Исследование транскриптома при преэклампсии - Анализ ассоциаций tagSNPs и гаплотипов генов LEP и ACVR2A с развитием гестоза в популяциях русских и якутов
Одним из активно разрабатываемых направлений с применением технологии микрочипов является исследование транскрипционных профилей при сложных заболеваниях. В этой связи плацента вызывает большой интерес как орган, продуцирующий широкий спектр биологически активных молекул, участвующих в развитии гестоза. Технология микрочипов позволяет одновременно отслеживать экспрессию десятков тысяч генов, создавая молекулярный портрет клетки [156]. Множество исследований плацентарных генов при преэклампсии позволило идентифицировать гены-кандидаты развития данного заболевания. В последние годы около 20 независимых исследований были направлены на изучение экспресии плацентарных генов при преэклампсии. Шесть из них осуществлялись методом анализа экспрессионных профилей. Большинство исследований не показало статистически значимых повышений уровня экспресии предпологаемых генов-кандидатов, кроме уровня экспресии гена LEP и FLT1. В одной из недавних работ была изучена избирательная экспрессия плацентарных генов у беременных с преэклампсией и женщин с неосложненным течением беременности [117]. На основе сравнительного анализа транскриптомных профилей плацентарных генов была подобрана панель из 213 генов, в таблице 1 представлены некоторые из них. Кроме того было экспериментально установлено что экспрессия гена LEP В 40 раз выше и в наибольшей степени коррелирует с тяжелым течением гестоза. При сравнении плацентарных генов между рано и поздно начавшейся преэклампсией (до 34 недель) были выявлены 168 генов оксидативного стресса, воспаления и эндотелиальной дисфункции, возникших в ранние сроки. Анализ профилей экспрессии, полученных с помощью биочипов, был подтвержден определением уровня экспрессии методом ПЦР в реальном времени, количественным определением хорионического гонадотропина в моче и гистопатологическим исследованием плаценты.
Таблица 1 - Дифференциально-экспрессирующиеся гены по данным полногеномных исследований экспресии генов плацентарной ткани женщин с физиологической беременностью и пациенток с преэклампсией*
Ген |
Продукт гена (белок) |
Популяция |
F C |
Автор |
LEP |
Лептин |
Норвегия |
40,0 |
Sitras 2009 |
Венгрия |
108,9 |
T. Varkonyi 2011 | ||
Япония |
10,9 |
Haruki Mishizava 2011 | ||
Корея |
4,4 |
Gui Se Ra Lee 2010 | ||
США |
5,5 |
Daniel A. | ||
FLT |
Рецептор сосудисто-эндотелиального фактора роста |
США |
2,8 |
Daniel A. |
Япония |
2,4 |
Haruki Mishizava 2011 | ||
Корея |
3,2 |
Gui Se Ra Lee 2010 | ||
Швеция |
2,4 |
M. Centlow 2011 | ||
Норвегия |
2,6 |
Sitras 2009 | ||
PAPPA2 |
Ассоциированный с беременностью плазменный белок А 2 типа |
Норвегия |
2,9 |
Sitras 2009, Mari LOSED 2011 |
Япония |
2,6 |
Haruki Mishizava 2011 | ||
Венгрия |
4,9 |
T. Varkonyi 2011 | ||
PCDH |
Протокадхерин |
США |
2.7 |
Daniel A. |
Норвегия |
2,0 |
Sitras 2009 | ||
VEGF |
Фактор роста сосудистого эндотелия |
Корея |
2,9 |
Gui Se Ra Lee 2010 |
Норвегия |
Mari LOSED 2011 | |||
INHA |
Ингибин альфа |
Швеция |
2,3 |
M. Centlow 2011 |
США |
1,9 |
Daniel A. | ||
Норвегия |
3,0 |
Sitras 2009 | ||
HEXB |
Гексоминидаза В |
США |
1,6 |
Daniel A. |
Япония |
Haruki Mishizava 2011 | |||
Норвегия |
Mari LOSED 2011 | |||
LDHA |
Лактодегидрогеназа |
Норвегия |
Mari LOSED 2011 | |
Корея |
2,1 |
Gui Se Ra Lee 2010 | ||
CGB |
Гонадотропин хориона |
Венгрия |
10,2 |
T. Varkonyi 2011 |
TMEM100 |
Трансмембранный белок 100 |
Япония |
4,7 |
Haruki Mishizava 2011 |
TMEM8 |
Трансмембранный белок 8 |
Норвегия |
5,0 |
Sitras 2009 |
CGB1, 2, 5, 7 |
Гонадотропин хориона1, 2, 5, 7 |
Япония |
4,4-4,7 |
Haruki Mishizava 2011 |
CGB CYP |
Гонадотропин хориона Цитохром Р450 |
Норвегия |
3,5 |
Sitras 2009, Mari LOSED 2011 |
Норвегия |
3,0 |
Sitras 2009, Mari LOSED 2011 | ||
США |
2,26 |
Daniel A. | ||
CGB1, 2, 5, 7 |
Гонадотропин хориона1, 2, 5, 7 |
Швеция |
3,3 |
K. Ionus 2011 |
Корея |
2,0 |
Gui Se Ra Lee 2010 | ||
OSM |
Онкостатин М |
Норвегия |
Mari LOSED 2011 | |
Корея |
3,5 |
Gui Se Ra Lee2010 |
*Примечание: В таблице представлены ДЭГ статистически значимо ассоциированные с риском ПЭ по данным нескольких исследований.
По мнею S. Founs, альтернативой ассоциативным исследованиям, нацеленным на изучение причин возникновения МФЗ, должны стать иследования дифференциальной экспресии генов в здоровых и пораженных заболеванием тканях[138].
Таким образом, развитие технологии микрочипов существенно расширило область молекулярных исследований до анализа целого генома и транскриптома (совокупность всех транскриптов в клетке). Технология микрочипов используется для расшифровки сложных механизмов возникновения гестоза, выявления генов предрасположенности к гестозу. Применение микрочипов в комбинации с другими подходами должно привести к разработке и созданию диагностических тестов, в том числе и на основе технологии микрочипов.
Похожие статьи
-
Семейный анализ сцепления Для гестоза полный геномный поиск (Genom-wide linkage studies) был проведен для пяти популяций на материале мультиплексных...
-
Полногеномный анализ ассоциаций tagSNPs с преэклампсией GWAS (Genom-wide association study) - полногеномный анализ ассоциаций позволяет выявить множество...
-
1) Провести анализ ассоциаций генотипов и аллелей исследованных полиморфизмов с гестозом в популяциях русских и якутов. 2) Оценить ассоциации...
-
Прогресс технологии генотипирования и разработка современных статистических методов предоставили новые возможности для изучения роли вариабельности...
-
Международный проект HapMap был создан и стартовал в 2002 году усилиями многих стран с целью каталогизировать индивидуальные генетические особенности...
-
Согласно одному из распостраненных определений, гестоз представляет собой синдром полиорганной недостаточности, возникающей при беременности, в основе...
-
Ранняя диагностика и своевременная профилактика различных заболеваний являются одной из наиболее актуальных проблем современной медицины. Самую...
-
Причины утомления: 1. В организме - 2. В мышце - в мышце во время сокращения накапливаются продукты обмена веществ (фосфорная кислота, молочная), которые...
-
При гистологическом исследовании тимуса мышей BALВ/c, содержавшихся при свободном доступе к пище и воде (1-я группа - пассивный контроль), установлено,...
-
Эксперименты выполнены на 350 белых беспородных крысах и крови 100 здоровых людей - доноров областной станции переливания крови. Все исследования на...
-
Для Республики Казахстан развитие биотехнологии является одним из приоритетов научно-технической политики. В соответствии с Стратегией...
-
Физические методы исследования - Основные методы обследования больного при различных заболеваниях
Ознакомившись с жалобами больного, историей развития болезни, социально-бытовыми условиями и особенностями семейного анамнеза, приступают к объективному...
-
"Обзорный" метод - Методы исследования популяции человека
Наиболее полноценным методом проведения популяционно-генетических исследований является "обзорный". Данный метод позволяет проводить обследование и...
-
Скринирующие программы - Методы исследования популяции человека
Государственные скринирующие программы на наследственные болезни обмена у новорожденных, один из примеров подобных исследований. Первый этап скрининга...
-
Полиморфные белки - Методы исследования популяции человека
Изучая генетическую структуру населения определенного региона проводятся исследования генетико-биохимического полиморфизма систем транспортных белков...
-
Ветспециалистам, осуществляющим отбор проб для исследования в ветлабораторию, необходимо знать, что патологический материал от павшего и вынужденно...
-
Железодефицитная анемия тяжелой степени тяжести. Обоснование предварительного диагноза. Диагноз: железодефицитная анемия средней степени тяжести...
-
Узагальнення результатів проведених досліджень на основі перерахованих параметрів оцінки ефективності очищення суднових стічних вод показало, що усунення...
-
Серологические Не проводились Аллергические Не проводились Другие исследования Не проводились РЕЗУЛЬТАТЫ ЛАБОРАТОРНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ Исследование крови...
-
Данные лабораторных и специальных исследований - Язвенная болезнь
Общий анализ крови: Показатели Гемоглобин 169 г/л Эритроциты 3.6 х1012/л Цветной показатель 1,0 Тромбоциты 220 Ретикулоциты 3% Лейкоциты 7,6х10*9/л СОЭ 6...
-
(с указанием их симптомов) Бронхообструктивный синдром : удушье, ослабленное везикулярное дыхание, хрипы. Повышенная воздушность легкого : эмфизематозная...
-
Современная наука включает в себя естественные, общественные и технические науки. Глобальные процессы, требующие своего междисциплинарного осмысления,...
-
РОФ - функционально разнородная группа белков, способных быстро изменять свою концентрацию при различных нарушениях гомеостаза независимо от природы и...
-
Диагноз при поступлении - Хронический панкреатит, стадия обострения
Хронический панкреатит в стадии обострения. Данные дополнительных исследований Биохимическое исследование крови : Билирубин общий (N 8,5-20,5 мкмоль/л)...
-
Генетико-демографическая характеристика популяций - Методы исследования популяции человека
Демографические параметры, витальные статистики и индекс Кроу и его компоненты, позволяют оценить интенсивность естественного отбора в популяции и...
-
Оценка случайного инбридинга методом изонимии - Методы исследования популяции человека
Фамилия - основная часть триединого полного русского именования человека - является очень интересным словом, которое может расцениваться и как памятник...
-
В настоящее время оценка генетической структуры различных популяций осуществляется с использование биологических и небиологических источников информации,...
-
1) [-]продолговатого и мозжечка 2) [+]зрительного бугра среднего мозга 3) [-]мозжечка 4) [-]больших полушарий переднего мозга При вдохе у птиц...
-
1) [-]икра находится в более глубоких слоях водоема, что спасает ее от перегрева 2) [+]темный цвет поверхности яйца, притягивающий солнечные лучи; икра...
-
Особенности современного мирового развития во многом определяются характером НТП. Последний развивается в соответствии с тремя типами логики: 1)...
-
Если в эпоху палеолита потребовалось 30 тыс. лет для удвоения населения мира, то к началу нашей эры удвоение происходило уже за 1 тыс. лет, к середине 19...
-
Концепция В. И. Вернадского о биосфере и феномен человека По В. И. Вернадскому, вещество биосферы разнородно по своему физико-химическому составу, а...
-
Понятие устойчивое развитие было введено в конце1980х в докладе междунар. комиссии по окр. среде "Наше общее будущее". Цель концепции-учитывая ресурсные,...
-
Генетические регистры - Методы исследования популяции человека
Определение распространенности максимально возможного числа нозологических форм наследственных заболеваний в популяции, возможно, путем создания...
-
Груз наследственных заболеваний является составной частью общего генетического груза популяций. Оценка отягощенности наследственной патологии в...
-
-полное равномерное -полное неравномерное -частичное +полное асинхронное неравномерное -частичное асинхронное На каком сроке эмбрионального развития...
-
- трофобласт и эмбриобласт - первичная полоска и Гензеновский узелок + эпибласт и гипобласт - эктодерма и энтодерма - синцитиотрофобласт и цитотрофобласт...
-
Нами была проведена сравнительная оценка различных механизмов персистенции вируса в организме гусениц непарного шелкопряда и условия ее перехода в острое...
-
6.1 манифестная форма (на ЭКГ признаки предвозбуждения желудочков в виде дельта-волны) 6.2 преходящая форма (эпизоды ЭКГ, на которых регистрируются...
-
Преходящая форма фибрилляции предсердий с указанием циркадной активности: 4.1.1 в дневные часы (чч. мм.) 4.1.2 в ночные часы (чч. мм.) 4.1.3 без...
Исследование транскриптома при преэклампсии - Анализ ассоциаций tagSNPs и гаплотипов генов LEP и ACVR2A с развитием гестоза в популяциях русских и якутов