Современное состояние систематики микроорганизмов - Идентификация коллекционных культур бактерий современными масс-спектрометрическими и молекулярно-генетическими методами
Систематика микроорганизмов - наука, изучающая разнообразие видов микроорганизмов и взаимоотношения между ними [Goodfellow, O'Donell, 1993]. Основной таксономической единицей бактериальной классификации является вид [Report of the ..., 2002]. Вид - основная таксономическая категория в классификации любой группы организмов. Так как биологическая концепция вида неприменима к прокариотам, бактериальный вид обычно рассматривается как прагматическая категория, которая описывает генотипически обособленные группы индивидуальных изолятов/штаммов, характеризующихся высокой степенью сходства по многим независимым свойствам, определенным при стандартизированных условиях [Rassello-Mora &; Amann, 2001; Report of the..., 2001].К одному виду обычно относят организмы, уровень ДНК сходства между которыми приблизительно 70% или выше [Report of the..., 2002]. Для прокариот и архей общепринятой является филогенетическая концепция вида. Из нее следует, что различные геновиды (т. е. группы штаммов, различаемые только на геномном уровне) не должны называться новыми видами до тех пор, пока не будут найдены фенотипические особенности, дифференцирующие их от описанных видов.
В настоящее время нет удовлетворительного филогенетического определения рода. Границы и критерии выделения родов могут отличаться для разных групп организмов [Murray, 1990; Rassello-Mora, Amann, 2001]. В случае, если уровень филогенетического сходства около 97% и выше, то организмы могут быть отнесены как к одному, так и к разным родам [Lechevalier, 1989].В последнее время классификация бактерий во все большей степени основывается на данных геносистематики [Stackebrandt, Rainey, Ward-Rainey, 1997], способствующих переходу таксономических исследований на более высокий уровень. Современная систематика бактерий является полифазной, т. е. базируется на интегрированном использовании различной информации о микроорганизмах, полученной с помощью молекулярно-биологических, химических и нумерических методов [Евтушенко, 1996].
Похожие статьи
-
В настоящее время в систематике бактерий осуществляется пересмотр сложившихся представлений, который благодаря своему бурному характеру и значению...
-
Микроорганизмы играют огромную роль в природных процессах и в течение многих лет являются "полигоном", где современная наука исследует фундаментальные...
-
Криолитозона представляет собой лучший природный палеобанк биологических, геологических, экологических, климатических и других данных [Gilichinsky,...
-
Всероссийская коллекция микроорганизмов Всероссийская коллекция микроорганизмов (ВКМ) функционирует как центр сбора, изучения, поддержания и...
-
Штаммы, используемые в работе, находились в лиафилизированном состоянии. Лиофилизация ? процесс высушивания под вакуумом из замороженного состояния....
-
Работа проводилась на базе Всероссийской коллекции микроорганизмов (ВКМ) Института биохимии и физиологии микроорганизмов (ИБФМ) им. Г. К. Скрябина РАН....
-
По результатам проделанной работы можно сделать следующие выводы: 1. На основании полученных морфологических и культуральных признаков микроорганизмов,...
-
В работе было использовано 45 (204, 205, 207, 210, 222, 223, 224, 250, 251, 3.15, 3.16, 3.17, 3.25, 3.26, 3.28, 3.58, 3.59, 3.70, 3.74, 3.73, 3.76, 3.92,...
-
ПЦР проводили в ДНК-амплификаторе "Gene Amp PCR System 9700" ("Applied Biosystems", США) с использованием бактериальных праймеров: прямого 27F и...
-
Выделение и очистку ДНК проводили методом по (Current protocols in, 1994). Для проведении ПЦР культуры выращивали в пробирках на среде ВКМ №55 при...
-
Для анализа масс-спектральных белковых профилей культуры выращивали на среде R2A (28С,48 ч). Клетки (~ одну колонию) переносили с помощью тонкого...
-
Материал для исследования следует брать по возможности до начала химиотерапии и лучше во время вскрытия или дренирования гнойного очага. Особенно...
-
Чувствительность микроорганизмов к антибиотикам и химиопрепаратам - это свойство микроорганизмов реагировать на действие данных препаратов приостановкой...
-
Мир микроорганизмов велик и разнообразен. Поэтому при классификации микроорганизмов встречается много трудностей, а полученные данные иногда бывают...
-
Заключение - Биологический возраст и методы его оценки
Существует потребность оценки степени старения или уровня жизнеспособности организма и его элементов, что является одной из ключевых задач...
-
Отношения между организмами в биоценозе - Особенности биоценоза
Можно говорить о разных типах отношений между организмами в биоценозе -- мyтуалистических, комменсалистических, хищнических, паразитических и пр. На этих...
-
Метаболизм микрообранизмов - Физиология микроорганизмов
Метаболизм микрообранизмов - совокупность всех биохимических процессов происходящих в клетке. Различают энергитичекий метаболизм 9катабализм) - реакции...
-
Общие методы изучения вирусов - Строгие постулаты Коха
О присутствии вируса в организме как при спонтанном заболевании, так и при экспериментальном заражении хозяина судят по появлению тех или иных...
-
Важное место в ритме ежедневного отдыха занимает сон. За последние годы несколько изменились взгляды на сон, как полный отдых мозга. Исследователи пришли...
-
ИСТОРИЯ СТАНОВЛЕНИЯ И РАЗВИТИЯ ПЕДИАТРИИ В РОССИИ - Этапы формирования современной педиатрии
Выделение Педиатрии в самостоятельную медицинскую дисциплину в России произошло в XIX в. Прежде детей лечили лишь на дому и самые общие вопросы тактики...
-
Эти простейшие передвигаются при помощи жгутиков, чем и объясняется название класса. Чаще всего имеется один жгутик, расположенный на переднем конце...
-
Занятия физической культурой с детьми, подростками и юношами должны быть направлены на гармоничное развитие, совершенствование функций организма и...
-
Особенности организма вшей (отр. Siphunculata) По образу жизни и по характеру питания на теплокровном хозяине вши очень сильно напоминают клещей. На всех...
-
ВВЕДЕНИЕ Близнецовый психогенетический наследственность генотип Психогенетика - наука о наследственности и изменчивости психических свойств, возникшая на...
-
При влиянии болезнетворных бактерий на человека в самом простом случае болезнетворные микроорганизмы лишь "крадут" питательные вещества хозяина. При этом...
-
Генетические методы изучения биопленок - Использование микробных биопленок в промышленности
Для выявления генов, участвующих в генетическом контроле любого процесса, используются методы направленного и ненаправленного (инсерционного)...
-
Методы культивирования биопленок В последнее десятилетие произошло значительное расширение возможности изучения формирования микробных биопленок....
-
Биологическими маркерами принято считать устойчивые биохимические, физиологические, анатомические и иные признаки организмов, варьирующие в норме в...
-
Законы наследственности, Достижения современной цитологии - Цитологические исследования
Второй этап в развитии цитологии как науки охватывает 1900-1935. Он наступил после того, как в 1900 были вторично открыты основные законы...
-
Методы исследования Испытуемым на первом этапе было предложено ответить на вопросы о заинтересованности в психотерапии: - Хотите ли Вы обратиться к...
-
Методы и организация исследования Анализ литературных источников проводился на всех этапах исследования. Анализ специальной научно-методической...
-
Регуляция транскрипции в клетках осуществляется на уровне индивидуальных генов, их блоков и даже целых хромосом. Возможность управления многими генами,...
-
Формулирование диагноза - Эссенциальная артериальная гипертензия (гипертоническая болезнь)
При формулировании диагноза эссенциальной АГ (гипертонической болезни) следует наиболее полно охарактеризовать все индивидуальные особенности течения...
-
На примере отряда блох рассмотрим большую группу переносчиков, для которых кровососание характерно лишь на одной из стадий развития -- имагинальной....
-
Экспрессия генов - Экспрессия генов
Экспрессия генов -- это процесс, в ходе которого наследственная информация от гена (последовательности нуклеотидов ДНК) преобразуется в функциональный...
-
Миопия (близорукость) возникает в основном на генном уровне. Если у одного из родителей диагностировано это заболевание, то у малыша возможно развитие...
-
Отравление тяжелыми металлами - Отравление тяжелыми металлами
Тяжелые металлы чрезвычайно токсичны даже в микроскопических дозах. Тяжелые металлы являются основным активным ингридиентом в большинстве пестицидов...
-
Вывод - Основные концепции самоорганизации
Мы рассмотрели основные концепции самоорганизации: синергетика (Г. Хакена) и теория диссипативных структур (И. Пригожина). Теория самоорганизации...
-
Предпосылки к естественной классификации - Эволюция состава организмов
Человечество вообще любит систематизировать полученные знания. Вернее, это диктуется необходимостью, поскольку лишь классификация тех или иных фактов и...
-
Термин "аллергия" был введен венским педиатром Клеменсом Фон Пирке в 1906 г. Он заметил, что у некоторых из его пациентов наблюдаемые симптомы могли быть...
Современное состояние систематики микроорганизмов - Идентификация коллекционных культур бактерий современными масс-спектрометрическими и молекулярно-генетическими методами