Современное состояние систематики микроорганизмов - Идентификация коллекционных культур бактерий современными масс-спектрометрическими и молекулярно-генетическими методами

Систематика микроорганизмов - наука, изучающая разнообразие видов микроорганизмов и взаимоотношения между ними [Goodfellow, O'Donell, 1993]. Основной таксономической единицей бактериальной классификации является вид [Report of the ..., 2002]. Вид - основная таксономическая категория в классификации любой группы организмов. Так как биологическая концепция вида неприменима к прокариотам, бактериальный вид обычно рассматривается как прагматическая категория, которая описывает генотипически обособленные группы индивидуальных изолятов/штаммов, характеризующихся высокой степенью сходства по многим независимым свойствам, определенным при стандартизированных условиях [Rassello-Mora &; Amann, 2001; Report of the..., 2001].К одному виду обычно относят организмы, уровень ДНК сходства между которыми приблизительно 70% или выше [Report of the..., 2002]. Для прокариот и архей общепринятой является филогенетическая концепция вида. Из нее следует, что различные геновиды (т. е. группы штаммов, различаемые только на геномном уровне) не должны называться новыми видами до тех пор, пока не будут найдены фенотипические особенности, дифференцирующие их от описанных видов.

В настоящее время нет удовлетворительного филогенетического определения рода. Границы и критерии выделения родов могут отличаться для разных групп организмов [Murray, 1990; Rassello-Mora, Amann, 2001]. В случае, если уровень филогенетического сходства около 97% и выше, то организмы могут быть отнесены как к одному, так и к разным родам [Lechevalier, 1989].В последнее время классификация бактерий во все большей степени основывается на данных геносистематики [Stackebrandt, Rainey, Ward-Rainey, 1997], способствующих переходу таксономических исследований на более высокий уровень. Современная систематика бактерий является полифазной, т. е. базируется на интегрированном использовании различной информации о микроорганизмах, полученной с помощью молекулярно-биологических, химических и нумерических методов [Евтушенко, 1996].

Похожие статьи




Современное состояние систематики микроорганизмов - Идентификация коллекционных культур бактерий современными масс-спектрометрическими и молекулярно-генетическими методами

Предыдущая | Следующая